Пегматиты являются продуктами кристаллизации остаточного магматического расплава-раствора, обогащенного летучими компонентами и редкими элементами. Пегматиты образуются в связи с магматическими интрузиями разного состава, по наиболее обычны и практически важны гранитные и, в меньшей степени, щелочные пегматиты.