Начиная с дрожжей и заканчивая человеком, в клетках эукариот обнаруживается 3 различных типа РНК-полимераз, характеризующихся специализацией синтеза определённых видов молекул РНК. Все эти ферменты являются высокомолекулярными белковыми комплексами с весом 500–700 кДа, отличаются сложным набором субъединиц, число которых в среднем насчитывается 7 (иногда 10 и более) на фермент. Некоторые субъединицы входят в состав нескольких типов РНК-полимераз.

 

РНК-полимераза-I. Обеспечивает синтез всех рибосомальных РНК (за исключением 5S-рРНК). В каждой клетке содержится до 40 тысяч молекул этого фермента, обеспечивающих синтез 50-70% суммарного объёма РНК.

РНК-полимераза-II. Обеспечивает синтез всех матричных РНК. В каждой клетке содержится до 30 тысяч молекул этого фермента, обеспечивающих синтез 20-40% суммарного объёма РНК.

РНК-полимераза-III. Обеспечивает синтез всех транспортных РНК и 5S-рРНК. В каждой клетке содержится до 20 тысяч молекул этого фермента, обеспечивающих синтез 10% суммарного объёма РНК.