Образование мочи происходит в две фазы: фильтрационную и реабсорбционную.

1. Фильтрация плазмы из капилляров мальпигиева клубочка в полость капсулы Шумлянского - Боумена (этому способствует высокое давление в приносящей артериоле). Плазма фильтруется со всеми растворенными в ней веществами, исключая крупные белки (чужеродные белки, как правило, имеют небольшую массу и могут выводиться с мочой). Так образуется первичная моча (включает глюкозу, аминокислоты, мочевину, мочевую кислоту, все соли), имеющая тот же состав, что и плазма крови.

2. Первичная моча поступает в почечные канальцы, где происходит реабсорбция (обратное всасывание) воды и ряда веществ из первичной мочи в кровь. Вода всасывается на 99 %. Вместе с водой всасываются аминокислоты, глюкоза, витамины, большая часть натрия, калия, кальция, хлора и др. Почти не всасываются продукты обмена, сульфаты, фосфаты. Также не всасываются избыточные количества глюкозы и солей, т.е. при повышенном уровне в крови весь избыток выводится с мочой. Таким образом, почки регулируют уровень веществ в крови. Реабсорбцию обеспечивают простая диффузия (она идет по градиенту концентрации, до выравнивания), активный транспорт (с затратой энергии, против градиента). Кроме того, эпителий почечных канальцев способен секретировать краски, лекарства, аммиак.

Обе почки содержат около 2,5 млн. почечных телец, через которые ежедневно протекают 1 700 л крови (со скоростью 1,2 л/мин.). Капиллярные сосуды почечных телец ежедневно выделяют в пространство боуменовых капсул примерно 180 л первичной мочи, однако 99 % ее объема через систему проксимальных канальцев реабсорбируется в кровь. Оставшаяся в почечных канальцах и собирательных трубочках жидкость концентрируется (образуется вторичная моча) и через сосочки подается в почечные чашечки. Из почечных лоханок моча через мочеточник попадает в мочевой пузырь, а оттуда через мочеиспускательный канал наружу.