Анализируя список 500 самых высокопроизводительных суперкомпьютеров мира - Top500 (http://top500.org), можно заметить что ~92% компьютеров работают под управлением операционной системы GNU/Linux, остальные ~8% приходятся на операционные системы Microsoft Windows, Unix и BSD-based.
Microsoft Windows – семейство проприетарных операционных систем корпорации Майкрософт (Microsoft), ориентированных на применение графического интерфейса при управлении. Операционные системы данного семейства работают на небольшом количестве платформ (x86,ч86_64, ia64, ARM). На суперкомпьютерах используется дистрибутив Windows HPC Server 2008.
Unix – группа переносимых, многозадачных и многопользовательских операционных систем. Отличительными особенностями данных систем можно считать: использование простых текстовых файлов для настройки системы, широкое применение утилит, вызываемых из командной строки, взаимодействие с пользователем с помощью терминала, представление физических и виртуальных устройств в качестве терминала. Примерами могут служить AIX, Solaris.
GNU/Linux – общее название UNIX-подобных операционных систем, работающих на основе ядра Linux и совокупности программ и библиотек созданных в рамках проекта GNU. Linux работает на широком спектре архитектур процессора. Примерами данной операционной системы являются: Red Hat Enterprise Linux (RHEL), Suse Linux Enterprise Server, CentOS, Debian и др.
Под BSD-based операционными система понимают UNIX-подобные операционные системы, восходящие к дистрибутивам университета Беркли. Примерами подобных систем могут служить FreeBSD, OpenBSD, NetBSD. Отличия от классических систем UNIX заключается в отсутствии переключения уровней выполнения, файловой системе, командного процессора.